有3种区别：纹理，南红表面上有风化纹，玛瑙则很少有风化纹存在;质地，南红有天然的胶质感，玛瑙质地较差一点;朱砂点，南红表面上有很多紧密的朱砂点，而玛瑙没有朱砂点。
- 纹理，两者在纹理上也存在着一定的区别，南红在自然形成的过程中，其表面上会有着自然形成的风化纹，视觉上给人一种自然利落的干净，而玛瑙所呈现出的纹理看上会柔和一点，很少会有风化纹的存在。
- 质地，两者所呈现出的质地大不相同，南红表面上呈现出天然的胶质感，其质地温润柔和，手感上比较润滑，类似于和田玉的手感，而玛瑙的质地会差一点，手感较为粗糙，甚至还有点扎手感。
- 朱砂点，南红的表面上有着朱砂点，在灯光的照射下，可以明显的发现南红表面上布满很多紧密的朱砂点，分布不均匀，而玛瑙在灯光的照射下，表面上是十分干净的，没有朱砂点的存在。
如何鉴别玛瑙
硬度，真玛瑙具有极高的硬度，在受到碰撞后会产生细粉状碎屑，假玛瑙则会形成碎块；气泡，真玛瑙内部不会有气泡的出现，假玛瑙内部则会出现明显气泡；色泽，真玛瑙色泽分布自然，不会掉色，假玛瑙色泽显得过于均匀浓艳，会掉色。
硬度，鉴别玛瑙可以看硬度，真玛瑙具有极高的硬度，在受到碰撞后会产生细粉状的碎屑，严重时会导致玛瑙破碎。假玛瑙受到碰撞后所形成的碎屑则并非细粉状，并且不会被摔碎。
气泡，鉴别玛瑙可以看气泡，用放大镜仔细观察玛瑙内部，真玛瑙由于材质天然的原因，内部不会有气泡的出现。假玛瑙因为大多是用人工合成材质制作的原因，内部气泡肉眼明显可见。
色泽，鉴别玛瑙可以看色泽，真玛瑙由于是天然形成的原因，色泽分布自然，用酒精擦拭后并不会掉色。假玛瑙上的色泽通常是染上去的，显得过于均匀浓艳，被酒精擦拭后即可掉色。
怎么挑选玛瑙
- 看颜色：要选择颜色鲜艳、纯正，色层厚实，条带明显的，其中以红玛瑙和蓝玛瑙为最佳。而假玛瑙的色种光都较差。二者一比，即露破绽。同时，还可以看纹路。用其他石料仿制的假玛瑙烟壶，多数在底部呈花瓣形花纹，俗称”菊花底”，而真的则不然。
- 看瑕疵：要选择表面光洁，透明度高，纹饰均匀、明晰的。从等级档次上看，优质高档产品，在用材时经过精选，故一般没有或少有瑕点，而次品上的瑕疵则较多。
- 看质地：要挑选质地细腻、坚韧，无裂纹或裂纹少的。假瑙是用其他石料仿制，特点是其料软;真玛瑙质地硬度可达7级，而假玛瑙一般只有5级。用玉可在假玛瑙上划出痕迹，而真的则划不出。用仪器鉴别更是显而易见。从表面质地看，真玛瑙的破碴或复眼处不亮，而仿制的假玛瑙则发亮，且气泡多。
